胎儿宫内发育迟缓的发病原因较复杂，不仅仅是营养不良等等诸如此类的简单原因。另外胎儿因为病症而引发的胎儿宫内发育不良也有以下几种。其中约有30%左右的原因还不明确。目前已知的发病原因有：
1、胎儿染色体异常(胚胎染色体异常的原因)，其发生率约为10%；
2、TORCH(指弓形虫、巨细胞病毒、风疹病毒、单纯疱疹病毒及其他病原体)宫内感染，约占10%；
3、孕妇患有妊高征、慢性高血压及慢性肾炎等疾患，导致胎盘血供障碍，造成胎儿慢性缺氧，影响胎儿正常生长发育；孕妇患有严重贫血(孕妇贫血的原因)、心肺疾患、胆汁郁积症等疾患时，也易影响胎儿的生长发育；
4、孕妇营养不良，尤其是蛋白质和热量摄入不足，是影响胎儿生长发育的重要因素之一，约占发生率的一半左右；
5、不良生活习惯，如吸烟(包括被动吸烟)、酗酒及吸毒等也是引起胎儿宫内发育迟缓的原因之一。
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