一、胎儿方面
自然分娩是指胎儿通过阴道分娩的过程，是自然的生理现象。首先，临产时子宫有规律地收缩，胎儿的胸腔会受到规律性的压力。这种规律性变化会导致胎儿肺部迅速产生磷脂，称为肺泡表面活性物质。因此，新生婴儿的肺泡是有弹性的，容易膨胀，从而快速建立起自主呼吸。
其次，在分娩过程中，胎儿被阴道挤压，呼吸道中的粘液和水被挤出，出生后患“新生儿吸入性肺炎”和“新生儿湿肺”的概率较低。此外，由于分娩过程中胎儿头部受压，血液流动速度减慢，会出现血液充盈，刺激呼吸中枢，以建立正常的呼吸节律。根据研究显示，自然分娩的胎儿脑部由于受到阴道的压迫，有利于未来智力的发育。
剖腹产是通过子宫腹部切口取出胎儿的过程。并不是对胎儿最安全的分娩方式。由于没有子宫规律性收缩的刺激，肺泡表面活性物质的产生相应地减少，有规律的自发呼吸减慢，导致新生儿容易患上肺部疾病。此外，剖腹产手术中可能会出现一下损伤。
1、骨折
（1）锁骨骨折：当胎儿前肩娩出不充分时，若急于抬起后肩，使前锁骨卡在子宫切口的上缘，导致骨折。
（2）股骨或肱骨骨折：股骨骨折多发于臀部，是操作者用力拉动下肢造成的。肱骨骨折是由操作者强行拉上臂造成的。
（3）颅骨骨折：常见于胎儿已进入骨盆入口较深部位或胎位异常的情况。是由在头部分娩期间，操作者在胎儿头部的某一部位施加了太大的力导致的。
2、软组织损伤：切割子宫时，由于子宫壁薄或操作者用力过大，导致划伤胎儿的先露部分。
二、母体方面
由于自然分娩是一种生理现象，其创伤小、较安全，而且产后能很快恢复健康，对产后的体型恢复有益。
相比之下，剖腹产手术，除了麻醉方面的风险外，还可能在术中或术后出现一些相应的并发症，其中较严重的有下列几种。
1、膀胱损伤：多见于腹膜外剖腹产时，分离膀胱层次时有误，或剖腹产术后再孕时，子宫切口瘢痕与膀胱粘连造成的损伤。
2、肠管损伤：如患者曾有过开腹手术或炎症造成管粘连，剖腹产时，易将肠壁误认为腹膜，造成误伤。
3、子宫切口裂伤漏缝而致产后大出血：剖腹产手术中常会出现切口延裂，边缘不齐，缝合时止血不完全，术后出现腹腔内出血。这种手术无疑要影响孕妇的身体恢复，而且子宫将永远存留疤痕，因此剖腹产术后，应特别注意避孕问题，万一避孕失败而做人工流产术时，会增加手术难度和危险性。若是继续妊娠，则无论在妊娠或分娩过程中，都存在子宫疤痕破裂的可能性。
目前，有许多孕妇及家属盲目要求以剖腹产结束妊娠，其理由不外乎是怕分娩时间过长，产妇遭罪，以及怕分娩方式造成孩子的损伤及智力障碍。不可否认，困难的产钳产、臀位产确有可能造成产伤，引起智力障碍。因而从母婴安全考虑，剖腹产的适应症已经有所扩大，但它毕竟是一种手术，并非是最完美的分娩方式，不能替代阴道分娩。
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