叶酸的常见副作用就是掩盖人体维生素B12缺乏的早期现象，延误最佳治疗时间，还会导致神经系统受到损害。
另一个常见的副作用就是影响胎儿的正常发育，服用过多叶酸后就会影响锌元素的吸收，导致母体缺锌使得胎儿补充不了足够的锌使得胎儿发育缓慢，低出生体重儿增加。另外叶酸过多还会有干扰抗惊厥药物的作用，诱发病人惊厥的发作。
补充叶酸已经是一种社会热潮，但是很多妇女对于叶酸的了解也不够全面，小剂量的叶酸（400微克一天）没有放副作用，可以促进优生，提高宝宝脑部发育，让宝宝可以更加聪明健康。但是孕妇若是大量摄入叶酸可能会使人类基因逐渐发生改变，这种变异会使孕妇罹患妊娠合并症。专家建议孕妈咪可以从怀孕前到怀孕的整个过程中持续补充叶酸，剂量把握在一天400微克一天。
食物补充叶酸是最安全并且最有效的方式，蔬菜瓜果中富含丰富的叶酸，孕妈咪可以适当的多吃一些，另外叶酸遇热容易分解，给孕妇烹饪菜肴时要改变烹饪习惯，食物不要长时间烹煮，以免影响营养价值。
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